Владимир Трубилин специализируется в области хирургии катаракты и рефракционной хирургии хрусталика, хирургии глаукомы.
Опыт работы:
С 1987 по 1989 год работал в отделе хирургии катаракты МНТК «Микрохирургия глаза» в должности научного сотрудника, а с 1989 по 1992 год — в должности старшего научного сотрудника.
В 1989 году консультант офтальмологической клиники «Casa Bianca» в г. Бари (Италия).
В 1990 году заведующий операционным блоком судна-клиники «Петр Первый» в г. Дубай (ОАЭ), медицинский директор судна-клиники «Петр Первый» в гг. Одесса, Ялта, Сочи, Батуми, Сухуми, Ларнака (Кипр).
С 1992 по 1996 год медицинский директор офтальмологической клиники в г. Сана (Республика Йемен).
С 1996 по 2006 год — заведующий Центральным отделением микрохирургии глаза КБ-86 (ранее МСЧ-12).
С 1997 года по настоящее время главный офтальмолог Федерального медико-биологического агентства (ФМБА России, ранее ФУ «Медбиоэкстрем»).
С 1998 года по настоящее время заведует кафедрой офтальмологии Института повышения квалификации ФМБА России.
С 1999 по 2002 год консультант клиники «Международный центр охраны зрения».
С 1999 по 2005 год консультант Медицинского центра Управления делами президента РФ.
С 2004 по 2006 год консультант клиник «Центр семейной офтальмологии», «Новый взгляд» («Новый ковчег»).
С 2007 года Руководитель Центра офтальмологии ФМБА России.
С 2010 года Председатель диссертационного совета по офтальмологии Д 208.120.03 при ФГОУ ДПО ИПК ФМБА России.
С 2010 года член экспертной комиссии по хирургическим наукам Высшей Аттестационной Комиссии Рособрнадзора.
С 2010 года член аттестационной комиссии при Министерстве здравоохранения и соцразвития РФ.
Главный редактор журналов «EyeWorld Россия», «Катарактальная и рефракционная хирургия», «Офтальмология», член редколлегии «Новости глаукомы».
В 2009 году Указом Президента Российской Федерации присвоено почетное звание «Заслуженный врач Российской Федерации».
C 2011 года президент Российского общества катарактальных и рефракционных хирургов
Автор 223 научных работ, 13 патентов и изобретений..